Biologia del genoma umano in condizioni fisiologiche e patologiche

Nel nostro laboratorio siamo interessati a capire la funzione degli elementi ripetuti del DNA nella regolazione epigenetica della risposta trascrizionale della cellula. In particolare ci chiediamo se i repeats possano influenzare la variabilità inter-individuale tra gli esseri umani come risposta all’ambiente, adattamento, e predisposizione allo sviluppo delle malattie. I repeats compongono circa il 70% del genoma umano, e la loro funzione è stata largamente ignorata per decenni. Ciononostante, è sempre più evidente il loro ruolo nel regolare l’epigenoma. Ad esempio, le sequenze ripetute sono coinvolte nella struttura del cromosoma, nella regolazione trascrizionale, nell’integrità genomica e nell’evoluzione del genoma. Inoltre, i consorzi FANTOM ed ENCODE hanno assegnato una pletora di funzioni regolatrici alle sequenze ripetute. Questi studi indicano un loro ruolo funzionale sia in cis sia in trans. Il lavoro del nostro gruppo potrebbe aggiungere importanti informazioni e nuove interpretazioni su come specifiche classi di DNA ripetuto possano influenzare i processi cellulari, il differenziamento e l’insorgenza di malattie. Il fine ultimo è quello di dimostrare che l’acquisizione in evoluzione di elaborate e fini regolazioni del programma trascrizionale della cellula rappresentino un valore aggiunto per i mammiferi, in particolare per l’uomo, per reagire all’ambiente, adattarsi allo stress, ed eventualmente essere predisposti meglio o peggio alla progressione di patologie. Il chiarire la funzione delle sequenze ripetute del DNA potrebbe alla fine rendere la biologia del genoma e l’epigenetica più vicini a forme veramente efficaci di medicina personalizzata.

Progetti

  • Studio delle dinamiche trascrizionali e genomiche dei trasposoni LINE1 nell’identità e plasticità cellulare dei linfociti T CD4+ primari umani
  • Studio della funzione di DNA satellite come orchestratore di un network di interazioni tridimensionali per l’espressione di unità trascrizionali durante il differenziamento cellulare e nelle malattie

Team

Nome / NameRuolo / RoleEmail
Alice Cortesi, PhDPost Doccortesi@ingm.org
Erica Gasparotto
Studentgasparotto@ingm.org
Federica Marasca, PhDPost Doc marasca@ingm.org
Shruti Sinha, PhDPost Doc, Bioinformaticiansinha@ingm.org
Rebecca VadalàPhD Studentvadala@ingm.org

Pubblicazioni

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